ルート

アライアンスルート1(最終ミッション:ジャック・O討伐)

アライアンスルート2(最終ミッション:地下部偵察)

中立ルート1(最終ミッション:インターネサイン破壊)

中立ルート2(最終ミッション:中枢突入)

バーテックスルート1(最終ミッション:未確認AC排除)

バーテックスルート2(最終ミッション:最終侵攻部隊せん滅)